1.宝宝在发育过程中出现了错误，如染色体异常，心血管错误，导致心脏发育到某过程就突然停了。还可能是因为家族的遗产。父母或者家里兄弟姐妹有先天性遗传的病史，这些都是可能遗传的因素。
2.母亲在怀孕的前三个月感染了病毒，像流感，糖尿病，风疹病毒。孕妇在怀孕的时候患有内分泌症，或者接受过放射治疗，接触过有毒有害品。孕妇的健康营养跟不上。这些都有可能影响胎儿心脏发育，并且导致心脏发育畸形。
3.有过不正常妊娠流产史引产史的高龄孕妇。此外近亲结婚孕有的小孩也是导致先天性心脏畸形的因素。胎儿羊水过多或者羊水过少，胎儿水肿，宫内发育迟缓都会在一定程度上影响胎儿心脏的健康发育。
4.胎儿心脏某部分发育到较低的阶段即停止，或由于发育的过程中发生了轴转的错误，如大血管易位。
5.小儿出生后，仍长期留存一部分胎儿期所需要的特殊心血管通路，如动脉导管未闭等。
6.母亲的疾病往往影响胎儿发育，母亲在妊娠最初3个月内被病毒感染，尤其是风疹病毒，则小儿易发生心脏畸形。
7.母亲在怀孕期间吃了某些药物，也可以导致胎儿心脏畸形。
8.某些可导致先天性心脏病的遗传因素。
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