胃肠道间质瘤在胃肠道肿瘤中，只占少数但却种类繁多形态复杂，过去由于病理学技术的限制胃肠道许多混有平滑肌纤维或神经束的梭形细胞肿瘤，常被诊断为平滑肌源性肿瘤或神经源性肿瘤。
它的症状如下：
一、胃肠道间质瘤的无特异性特征
胃肠道间质瘤的症状依赖于肿瘤的大小和位置，通常无特异性。胃肠道出血是最常见症状。而在食管，吞咽困难症状往往也常见。部分病人因肠穿孔就诊，可增加腹腔种植和局部复发的风险。
二、转移是胃肠道间质瘤的重要特征之一
胃肠道间质瘤病人第一次就诊时约有11～47%已有转移。转移主要在肝和腹腔，淋巴结和腹外转移即使在较为晚期的病人也较为罕见。转移瘤甚至可发生在原发瘤切除后30年。小肠胃肠道间质瘤恶性程度和淋巴结转移率最高，而食道胃肠道间质瘤恶性程度低。因此，严格来说，胃肠道间质瘤无良性可言，或至少为一类包括潜在恶性在内的恶性肿瘤。
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