阴茎上长小疙瘩可能是由于皮肤炎症、感染或者性传播疾病等原因引起的，通常需要针对具体原因进行处理。一般的方法主要有生活调理、物理治疗和药物治疗等，一般需根据具体情况进行选择。
1.生活调理
首先要保持局部的清洁和干燥，避免使用刺激性的清洁用品。同时，要避免过度的性行为和手淫，以免加重症状。此外，饮食上要清淡，避免辛辣、油腻等刺激性食物，多吃蔬菜水果，保持大便通畅。
2.物理治疗
如果疙瘩较小，可以尝试使用冷敷或者热敷的方法，以缓解局部的炎症和肿胀。但要注意温度适中，避免烫伤皮肤。此外，还可以尝试使用紫外线照射等物理疗法，以促进局部血液循环，加速疙瘩的消退。
3.药物治疗
如果疙瘩较大或者伴有疼痛、瘙痒等症状，可以在医生指导下使用一些外用药物，如酮康唑、克霉唑、特比萘芬等抗真菌药物，以抑制真菌感染。如果疙瘩伴有红肿、疼痛等炎症表现，可以使用红霉素、氯霉素、四环素等抗生素软膏，以控制局部感染。如果疙瘩是由性传播疾病引起的，如尖锐湿疣、生殖器疱疹等，需要在医生指导下使用抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等。
阴茎上长小疙瘩的原因多样，如果疙瘩持续存在或者症状加重，建议及时就医，明确诊断，对症治疗。同时，要注意个人卫生，避免不洁性行为，以减少感染的风险。