藿香正气丸作为传统中成药，一般具有解表化湿、理气和中、止呕、止泻、解暑等功效和作用。其组方遵循中医理论，适用于外感风寒、内伤湿滞等证候。
1、解表化湿
方中药物多具有辛温发散特性，能驱散体表寒邪，同时通过芳香化湿作用消除体内湿气，适用于恶寒发热、头身困重等外感夹湿症状。现代研究显示其可能通过调节体温中枢发挥作用。
2、理气和中
所含理气类药物能疏畅气机，调和脾胃运化功能，可缓解湿阻中焦引起的脘腹胀满、食欲不振。其调节胃肠动力的作用机制与改善消化液分泌有关。
3、止呕
对于湿浊阻滞、胃气上逆导致的恶心呕吐，药物中的和胃降逆成分可通过调节胃肠平滑肌收缩频率发挥作用，尤宜暑湿引起的胃肠型感冒呕吐。
4、止泻
通过温化寒湿、健脾助运作用，能改善寒湿内盛所致的腹泻便溏。药理实验表明其具有抑制肠道异常蠕动及抗炎作用。
5、解暑
针对夏季暑湿侵袭出现的头晕胸闷、纳呆乏力，其化湿醒脾功效可改善机体暑湿状态，可能通过调节水盐代谢平衡实现解暑效果。
该药适用于外感风寒、内伤湿滞的胃肠型感冒及急慢性胃肠炎。服用期间需忌食生冷油腻，糖尿病患者应注意剂型选择。中病即止不宜久服，妊娠期及过敏体质者应咨询医师。若出现高热不退或脱水症状，应及时就医进行补液等综合治疗。