目前，对本病的发病机制意见不一，多认为下疝是在胚胎期后颅凹中线结构脑组织过度生长延伸，加之后颅凹的容积缩小，更促使其向下穿经枕大孔疝入颈椎管内，有的甚至降至枢椎或更低，以至严重损害小脑，脑干和高位颈髓，颈神经等，并可引起脑积水，本病常合并其它枕大畸形，如颅底凹陷，寰枕融合，扁平颅底，颈椎分节不全等。
小脑扁桃体下疝常并发以下疾病：常合并其它枕大畸形，如颅底凹陷，寰枕融合，扁平颅底，颈椎分节不全等。术中并发症，如感染等。
轻度小脑扁桃体下疝可无症状，外伤，感染，咳嗽及腰椎穿刺可诱发症状或使症状加重，由小脑扁桃体下疝引起的症状大体有以下几方面：
1、颅神经和颈神经症状：表现为声音嘶哑，吞咽困难，颈项部疼痛及活动受限等。
2、脑干延髓症状：可出现肢体运动障碍，偏瘫和四肢瘫，四肢感觉障碍，及大小便障碍等。
3、小脑症状：可出现共济失调，走路不稳及眼球震颤。
4、颅内压增高症状：可出现头疼，呕吐，眼底水肿及视力下降等脑积水表现的。
5、脊髓空洞症表现：伴有脊髓空洞时可出现感觉分离或双上肢肌萎缩等。
本病预防措施无特殊，要注意用药安全：
1、手术治疗后适当的神经营养治疗可能在一定程度上起到促进神经功能恢复的作用，但不手术治疗而单纯用药则不能遏制神经损害的加重，
2、对症治疗通常能起到止痛和抗头晕的作用，能改善症状从而提高生活质量，对减轻神经损害无作用，
3、对于暂不需手术，存在手术禁忌证或不愿接受手术治疗者，适当的药物治疗是有益的
为明确诊断和鉴别诊断需要，MRI检查可以清楚地显示小脑扁桃体下疝的具体部位，有无延髓及第四脑室下疝，脑干的移位，有无脊髓空洞及脑积水等，X线平片检查及CT可了解颅颈部骨性畸形情况。
患者饮食要遵医嘱给予饮食，饮食要以稀软开始到体内逐步适应后再增加其他饮食，应选用高蛋白、高维生素及容易消化的食物经过合理的营养搭配及适当的烹调，尽可能提高患者食欲，使患者饮食中的营养及能量能满足机体的需要。如木耳，鸡汤，鸽子汤，胡萝卜等等。其次，患者不宜服用对病情不利的食物和刺激性强的食品，如辣椒，烟酒，咖啡，浓茶等。
一、手术原则
以手术治疗为主要手段，其目的是解除枕大孔及颈椎对小脑、脑干、脊髓、第四脑室及其他神经组织的压迫，疏通脑脊液循环，缓解神经受压症状和脑积水。对少数小脑扁桃体下疝严重的病人，可考虑切除小脑扁桃体；有证据提示Ⅳ脑室正中孔粘连者，可予显微分离；有脑积水者酌情行分流术。
二、用药原则
1、注意水电解质平衡，术中补充失血。
2、术后酌情预防感染，使用营养神经药物。
3、对症治疗。