人类的肺炎衣原体感染是世界普遍性的。肺炎衣原体传染途径是通过呼吸道分泌物的人-人传播。因此，在半封闭的环境如家庭、学校、军队以及其他人口集中的工作区域可存在小范围的流行。肺炎衣原体的感染还可能与哮喘、冠心病及动脉粥样硬化的发病、慢性阻塞性肺疾病的急性发作和恶化有关。目前，肺炎衣原体已是继肺炎双球菌和流感嗜血杆菌之后引起社区获得性肺炎的主要病原体，与嗜肺军团菌和肺炎支原体一起成为社区获得性肺炎的三种非典型病原体，占社区获得性肺炎的10％～20％。
肺炎衣原体肺炎常继发细菌感染，伴心内膜炎、心肌炎等。患者体温通常在37.8-38.5℃并伴有胃寒，但真正寒战（如肺炎双球菌肺炎患者）很少见。与流感非典型肺炎临床表现不同的是，肺炎支原体肺炎患者的肌肉酸痛、胃肠道症状很少见。与腺病毒肺炎区别是后者有时伴随有腹泻，但肺炎支原体很少有腹泻。
肺炎衣原体感染的潜伏期为15～23天，可引起上呼吸道感染，如鼻窦炎、中耳炎和咽炎；也可引起下呼吸道感染，但以后者为主，如支气管炎和肺炎。肺炎衣原体肺炎系衣原体肺部感染的主要形式，不同于鹦鹉热肺炎，此病患者无病鸟接触史，肺炎衣原体呼吸道感染多数表现为咽痛、发热、咳嗽（干咳为主）、胸痛、头痛、不适和疲劳。受累的肺叶部位可听到啰音，但再感染的患者呼吸道症状往往较轻，且较少发展为肺炎，老年肺炎衣原体肺炎患者临床表现可能较为严重，有时是致死性的，尤其是合并细菌性感染或存在慢性阻塞性肺疾病等基础疾病时。
肺炎衣原体肺炎系人类呼吸道疾病，与动物宿主无关，所以按一般呼吸道感染疾病预防即可患者应注意休息，保持室内空气流通，并给予足量的维生素、蛋白质，多饮水、少食多餐，保持呼吸道通畅酌情给予吸氧及其他对症治疗注意合理的养气润肺，健脾疏肝，调整营卫
肺炎衣原体肺炎应该做衣原体培养、微量免疫荧光试验及X线胸片等检查，具体如下。
1、衣原体的培养：取鼻咽部或咽后壁拭子，气管和支气管吸出物，肺泡灌洗液等标本培养。
2、微量免疫荧光试验（MIF）：是目前国际上标准的且是最常用的肺炎衣原体血清学诊断方法，除性病门诊患者和娼妓特定人群外，肺炎衣原体肺炎的MIF血清学诊断可使用肺炎衣原体单一抗原，即不需要同时检测沙眼衣原体和鹦鹉热衣原体抗体，血清学诊断标准为：MIF试验IgG≥1∶512和（或）IgM≥1∶32，在排除类风湿因子（RF）所致的假阳性后可诊断为近期感染，双份血清抗体滴度4倍或以上升高也诊断为近期感染，1∶16≤IgG
3、X线胸片：开始主要表现为单侧肺泡浸润，以后可进展为双侧间质和肺泡浸润，肺炎衣原体感染复发较为常见，尤其抗生素治疗不充分时，但较少累及呼吸系统以外的器官。
肺炎衣原体肺炎患者的饮食以清淡、易消化为主，多吃蔬果，合理搭配膳食，注意营养充足。此外，患者还需注意忌辛辣、油腻、生冷的食物。
肺炎衣原体肺炎的治疗一般是抗生素治疗，具体如下。
1、抗生素治疗：肺炎衣原体感染的治疗与肺炎支原体相似，简单而有效，耐药不多见。但与肺炎支原体肺炎治疗不同处在于治疗的时间要长，以防止复发和清除存在于呼吸道的病原体。
主要为抗生素治疗，首选治疗为红霉素，每次0.5g，4次/d；或多西环素，首剂0.2g，以后每次0.1g，2次/d；或四环素（不用于孕妇和儿童），每次0.25～0.5g，4次/d；口服，疗程均为21天。新生儿和婴儿的用量为红霉素每天40mg/kg，疗程2～3周。一般用药后24～48h体温下降，症状开始缓解。应当注意.即使用此疗法，部分病例仍可复发。如果没有禁忌，可进行第2疗程治疗。近年来，也有采用克拉霉素和阿奇霉素治疗肺炎衣原体感染的报道，其中阿奇霉素的疗效要优于克拉霉素，但临床应用经验尚少。其用法为克拉霉素，0.5g/次，2次/d，疗程21天；阿奇霉素，第1天0.5g，后4天0.25g/次，2次/d。亦可应用利福平（0.15g/次，3次/d），罗他霉素（0.2g/次，3次/d），罗红霉素（0.15g/次，2次/d）进行治疗。肺炎衣原体对氟喹诺酮类也敏感，如氧氟沙星或托氟沙星（0.2g/次，2次/d）可用于成人患者的治疗，但不推荐用于儿童。
2、注意事项：抗生素疗程一定要充足，以防复发。如果红霉素的剂量太小，或疗程太短，常使全身不适、咳嗽等症状持续数月之久。