单纯性肾囊肿的可为先天性肾小球、肾小管结构变异所致，也可因后天损伤、感染等造成。
单纯性肾囊肿发病机制尚未完全阐明，虽属非遗传性先天性疾病，但Schnlzinger(1994)等发现两个单纯性肾囊肿家族，对其进行基因连锁分析尚未发现与常染色体显性遗传性多囊肾(ADPKD)有关，认为可能存在常染色体显性遗传性单纯性肾囊肿。病变多见于肾下极。囊肿起源于肾小管，突出于肾皮质表面，外观呈蓝色，也可位于皮质深层或髓质。一般直径为1cm以下，也可有3～4cm，个别可达10cm或以上。囊内含无菌清亮琥珀色液体，5％为血性液体。其中约1/3～1/2的病例有囊壁恶性病变。囊壁薄，内衬单层扁平上皮，也有纤维化和钙化呈鸡蛋壳状。下极囊肿可压迫输尿管引起梗阻性积水和感染。
单纯性肾囊肿引发的并发症：
囊肿位于肾门处压迫肾动脉，引起血浆肾素增加，可导致高血压；或引起肾盏梗阻继发感染，具体如下：
1、在未用抗高血压药情况下，收缩压≥139mmHg和/或舒张压≥89mmHg，按血压水平将高血压分为1，2，3级。收缩压≥140mmHg和舒张压 2、梗阻性肾病指尿路尿液流通障碍，产生后向压力，影响肾实质的正常生理而导致的肾脏病变。梗阻程度有完全性和部分性；范围有双侧性和单侧性；时间有急性突然发生和缓慢渐进性发生；部位有上尿路和下尿路；上尿路在输尿管-膀胱连接点以上(输尿管，肾盂，输尿管-肾盂连接处)；下尿路位于输尿管-膀胱连接点以下(尿道，膀胱颈，膀胱-输尿管连接处)。肾脏受到的影响与梗阻程度和时间有关，早期去除梗阻可使病变消失，晚期则使肾功能永久性丧失而不能逆转。故认识梗阻性肾病，及时解除梗阻至为重要。
单纯性肾囊肿常于成年时期发病，一般无临床症状，不影响肾功能，偶尔由于出现血尿而就诊，绝大多数病人是在作B型超声或CT检查时偶然发现，尿液检查正常，血尿罕见，但肾囊肿可引起腹痛及发现腹部包块，高血压等，如囊肿破入肾盂肾盏系统，可有血尿，囊肿亦可导致肾盂，肾盏梗阻症状。
由于尚无有效的治疗方法，防治肾脏并发症和维持肾功能是主要预防目的
对本病患者应避免近身接触性活动，尤其是碰撞、挤压，以防囊肿破裂本病患者易发生尿路感染，尤其是女性，必须积极对症及支持治疗
单纯性肾囊肿的化验检查包括：
一、影像学检查
1、B超为首选检查方法，典型B超表现为病变区无回声，囊壁光滑，边界清楚，当囊壁显示不规则回声或有局限性回声增强时，应警惕恶性病变;继发感染时囊壁增厚，病变区内有细回声；伴血性液体时回声增强。
2、CT对B超检查不能确定者有价值，囊肿伴出血或感染时，呈现不均质性，CT值增加，当CT显示为囊肿特征时，可不必再作诊断性穿刺。
3、IVU能显示囊肿压迫肾实质或输尿管的程度。
4、MRI能帮助确定囊液性质。
二、囊肿穿刺和囊液检查
当B超、CT等不能确诊或疑有恶性病变时，可在B超引导下行囊肿穿刺，抽取囊液化验，囊肿继发肿瘤时，囊液为血性或暗褐色，脂肪及其他成分明显增加，细胞学阳性，肿瘤标记物CA-50水平增高，合并感染时囊液呈暗色浑浊，脂肪及蛋白含量中度增加，淀粉酶和LDH显著增高，细胞学检查有炎性细胞，囊液培养可确定病原菌，抽出囊液后，注入造影剂和(或)气体，能显示囊壁情况，若囊壁光滑表示无肿瘤存在。
单纯性肾囊肿的饮食注意事项：
一、宜食用食物
单纯性肾囊肿宜食清淡易消化食物，新鲜蔬菜和适量水果，适当饮水。注意膳食营养均衡。
二、禁忌食物
肾囊肿饮食应忌辛辣刺激类，如辣椒等；忌酒类；吸烟(包括被动吸烟)；忌巧克力；咖啡、海鱼、虾、蟹等“发物”；忌过咸类食物，特别是腌制类；忌被污染的食物如不卫生的食物、腐烂变质的、剩饭剩菜等；忌烧烤类食物。
三、限制服用食物
1、蛋白质的控制：现代医学认为，蛋白质摄入过低或过多，对肾脏都无益处。尤其是大量摄入蛋白质后，可产生过多的代谢产物，如尿毒症毒素中尿素、肌酐、胍类、多胺和某些中分子物质基本上都是氮(蛋白质)的代谢产物。控制蛋白质(肾衰时低蛋白饮食)对于减轻肾脏负担，减少尿毒症毒素的产生，缓解病情均起重要作用。
2、食盐摄入的限制：控制食盐时，根据病人病情和肾功能程度作调整，但并非所有的慢性肾功能不全病人都要严格限盐。
3、水的摄入：单纯性肾囊肿时，由于肾脏浓缩功能下降，体内代谢产物需要较多的水分才能从肾脏排出，因此，单纯性肾囊肿病人如无明显的水肿、心衰、高血压时，不应盲目限水。
单纯性肾囊肿发展慢，不一定损害肾脏，且发现时多数患者年龄已较大，其治疗趋于保守。
1、无肾实质或肾盂肾盏明显受压无感染、恶变、高血压或上述症状不明显时，即使囊肿较大，亦不主张手术，而应采取B超检查密切随访。
2、当继发感染时鉴于抗生素能穿透囊壁，进入囊腔，可首先采用抗生素治疗和超声引导下穿刺引流。失败无效时再考虑开放手术。
3、若证实囊肿有癌变或伴发肾癌，应尽早手术治疗。
4、囊肿直径大于4cm时可行穿刺和硬化剂治疗，硬化剂的选择应慎重。四环素具有硬化和预防感染双重作用，疗效达96％，副作用小。磷酸铋疗效亦佳，44％囊肿完全消失，52％缩小，无严重并发症。
5、当上述处理无效，症状或囊肿感染明显时，可行囊肿去顶术或作肾部分切除术。
6、如因囊肿导致患肾严重感染，肾功能已严重受损而对侧肾功能正常时，可作肾切除术。
总之，单纯性肾囊肿的治疗，必须综合考虑囊肿对肾脏和全身的影响，并视囊肿的发展而定。若上述情况并不明显，宜密切随访观察，不必急于治疗。