克罗恩病关节炎的病因还不明。有细菌、病毒、真菌、原虫等感染学说；淋巴管阻塞和淋巴细胞聚集学说；炎症循环障碍学说等都难定论。目前已肯定本病患者HLA-1327大多阳性，说明遗传素质是本病的致病因素。近年来从病理形态学的多样性，疾病的慢性炎症特性，肉芽肿的存在，多系统损伤如关节炎、皮肤损害及免疫抑制治疗有效等方面考虑，免疫调控机制障碍也是致病的重要原因。
克罗恩病关节炎局部并发症有窦道或瘘管、直肠周围感染、肠梗阻、肠穿孔、腹腔脓肿等；全身性并发症有关节炎、结节性红斑、脉管炎等。
克罗恩病关节炎主要发生于青壮年，以15～35岁为多见，高龄者以结肠受累为主，回盲部病变占50％以上，病变仅限于结肠者占10％，结肠和小肠均受累者占30％以上，起病多缓慢。具体症状如下：
一、消化系统
腹痛是其最常见症状，疼痛多位于脐周和右下腹，为便前轻度绞痛或不适便后可缓解，腹泻一般每天3～6次，由于胆汁酸、水和脂肪吸收障碍，故粪便呈半液状，病变累及结肠时，可出现大便失禁，表现里急后重，在病程后期可扪及包块。
二、皮肤
结节性红斑为本病常见的皮损，通常与疾病的活动性相平行，主要分布于下肢伸侧，有的可形成溃疡。
坏疽性脓皮病是一种深的，坏死性溃疡性皮肤损伤，疼痛明显，多位于下肢胫骨前区，常伴有全身症状，病变为单个，也可为多发性或广泛性，若不治疗，病变可向深部发展而引起骨髓炎，其他皮损包括湿疹、斑丘疹、红斑、荨麻疹和多形性红斑等。
三、关节炎
1、周围关节炎：有10％～20％的克罗恩病患者发生周围关节炎，系克罗恩病最常发生的肠道外表现，并主要见于结肠受累的病人，其累及关节类似溃疡性结肠炎，为亚急性非对称性少关节炎，以膝关节最常受累，其次为踝关节，再次为肩关节、腕关节、肘关节、掌指关节、大关节较小关节易受累，下肢关节较上肢关节易受累，关节炎常不留畸形，但可引起关节疼痛、触痛，有时可伴有关节积液，关节症状一般持续数周甚至一个月以上。
2、脊柱炎：1％～25％的病人可发生强直性脊柱炎，应用严格标准确定约为5％，大多数病人骶髂关节症状不明显，关节放射学检查发现的骶髂关节炎要比有症状的骶髂关节炎多3倍，脊柱炎可发生于肠道病变之前，之后或同时，且与肠道病变活动性不平行，控制肠道症状脊柱炎也不会缓解，部分病人可出现杵状指，尤以小肠上段受累者多见，有杵状者，其内瘘和吸收不良的发生率也较高。
四、泌尿生殖系统
尿路结石是克罗恩病常见的并发症，多见于结肠切除和回肠造瘘术者，这可能是由于严重腹泻或回肠造瘘使大量分泌物丧失，尿液浓缩，引起尿pH值降低，而形成尿酸盐结石，胆盐吸收障碍，使小肠内草酸盐吸收过多，也是引起尿路结石的原因，此外，梗阻性肾盂积水，肾周围脓肿和肾淀粉样变病及肠瘘管形成导致尿路病变等，也可引起尿路结石。
五、其他
病人可有不同程度的发热，部分病人可出现睑缘炎、结膜炎、角膜炎、角膜溃疡和巩膜炎等，眼部表现一般发生在肠道病变的急性恶化期，病情缓解时即消失，但可反复发作。
克罗恩病关节炎的预防方法：
一、消除和减少或避免发病因素，改善生活环境空间，改善养成良好的生活习惯，防止感染，注意饮食卫生，合理膳食调配
二、注意锻炼身体，增加机体抗病能力，不要过度疲劳、过度消耗、戒烟戒酒
三、早发现早诊断早治疗，树立战胜疾病的信心，坚持治疗
克罗恩病关节炎的临床检查具体如下：
一、血常规及血沉：由于失血或骨髓抑制，以及叶酸或维生素Bl2吸收不良，可引起贫血，不同程度的白细胞增多和血沉增速，可反映出病变的活动和炎症程度。
二、生化学检查：血清α2球蛋白升高，腹泻明显者常见低钾、低镁、低钙血症是由于广泛肠黏膜受累和维生素D吸收不良所造成的，低蛋白血症是由于蛋白质漏出而引起的，十二指肠液检查甘氨酸和牛黄酸含量比值增高，提示末端回肠病变广泛，血清溶菌酶能反映出活动性肉芽肿的炎症程度，其正常值为5mg/L，本病则在10mg/L以上，可用以判断病期活动性及观察治疗效果，广泛小肠切除有碘-聚维酮试验(Ⅰ-PVP)异常(正常人粪便排泄率
三、免疫学检查：类风湿因子、狼疮细胞均为阴性，HLA-B27阳性者易发生周围关节炎或者强直性脊柱炎，血清IgA示预后良好。
四、X线检查：发病部位以末端回肠为多见，早期由于黏膜下层炎症水肿，X线检查表现肠黏膜皱襞增粗，变平及消失，病变肠形态较固定，但肠管一般无明显狭窄，其他肠道可出现分节，舒张等功能改变，由于分泌增多，钡剂常分散呈斑片状，随着病变的发展，黏膜下层可有大量肉芽组织增生，黏膜皱襞可出现卵石样或息肉样充盈缺损，溃疡形成后，肠腔充盈时轮廓常呈锯齿状或尖刺状，此即龛影所在，肠管外形常固定，局部蠕动消失，因肠壁增厚，肠间距可增宽，晚期肠段可发生大量纤维化，肠腔明显狭窄时，X线显示肠腔呈线状不规则狭窄，黏膜皱襞消失，狭窄段长短不一，从1～2cm到较长范围不等，而且可以间断多发，有时见机械性肠梗阻的X线表现，但多为不完全性肠梗阻。
局限性肠炎单独侵犯结肠者较少见，多发生于右侧结肠，尤以盲肠好发，并常同时伴有回肠末端病变，结肠受侵犯时也可发生于多个节段，并累及左侧结肠，早期表现为结肠动力增速，刺激征象明显，钡剂不易充盈，慢性期肠腔变窄，肠袋变浅或消失，多为一侧性，但有时亦可呈对称性，肠管边缘可有乳头状高低不平的突出或有纵行的小溃疡。
除小肠及结肠改变外，还可出现多发性周围性关节炎，但在X线上可以不出现关节侵蚀改变，骶髂关节炎的X线改变同强直性脊柱炎，Acheson(1960)发现，在742例局限性小肠炎病例中，2、3％有强直性脊柱炎。
五、内镜检查：纤维结肠镜检查可发现小的和初期病变，通过活检可获得确切诊断，内镜可见：1、溃疡；2、黏膜呈铺路石形；3、充血，水肿；4、袋形改变，狭窄，假息肉形成等，肠壁溃疡有两种：一种为细小溃疡，多见于早期；另一种为较大的圆形，椭圆形或缝状溃疡，在病灶处活检可找到典型的肉芽肿和非特异性炎症乙状结肠镜检仅对直肠和乙状结肠病变有价值，部分病人活检可见到肉芽肿，食管、胃、十二指肠和空肠病变者，可作纤维内镜检查。
克罗恩病关节炎不要吃海产品，疾病活动期也不建议喝牛奶及乳制品。忌选粗纤维的食物和加工粗糙的食品。应尽量限制食物纤维，如韭菜、芹菜、白薯、萝卜、粗杂粮、干豆类等。疾病活动期应忌食生蔬菜、水果，可制成菜水、菜泥、果汁、果泥等食用。不要用大块肉烹调，要经常用碎肉、肉丁、肉丝、肉末和蒸蛋羹、煮鸡蛋等形式。不宜吃油腻食物，忌刺激性食物，应禁忌辣椒、芥末、酒等辛辣刺激食物，少吃大蒜、生姜、生葱。也不要食用过冷、过热的食物。酒茶、咖啡、冷食和调味剂等不宜食用。
克罗恩病关节炎的治疗方法有以下三种：
一、全身治疗：包括柳氮磺吡啶(柳氮磺胺吡啶)、糖皮质激素、硫唑嘌呤等，使用前应除外肠结核。鉴别困难者可先行2～3个月的抗结核治疗。
SSZ为首选药物，开始每天2～3g，分4次口服，活动期每天4～6g，维持量为每天2～3g。若用药2周无效，可改用泼尼松每天30～40mg，分3～4次口服。严重者可用ACTH20～40U肌注或静滴。有降结肠病变者，可并用氢化可的松保留灌肠。SSZ对早期病例有效，见效后应尽早减量，有腹腔内感染和败血症者禁用，有瘘管形成者慎用。长期用药能引起菌群失调，使手术病例增加，病死率也明显上升。
硫唑嘌呤或巯嘌呤(6-巯基嘌呤)与糖皮质激素合用，可减少后者的用量，但单独使用不比SSZ和糖皮质激素效果好。甲硝唑(灭滴灵)每天0.4～0.6g，分2～3次口服，对不太顽固的病例有效。
二、外科治疗：需手术者达70％以上，急性者往往被误诊为急性阑尾炎而予手术，一旦发现是本病，就不能行阑尾切除，否则可形成肠瘘。手术的适应证包括不可逆性肠狭窄或肠梗阻、难治性肠瘘、腹内脓肿、穿孔、大出血、癌变和内科治疗无效者。手术效果不如溃疡性结肠炎好，复发率高达50％以上。手术后由于胆汁酸代谢变化及肠内细菌丛变动，可引起有机酸代谢障碍、胆石症、尿路结石或骨关节障碍，有时手术可成为直接或间接的死亡原因，故应慎重，切除范围不宜超过3.0cm。
三、对症治疗：急性及活动期宜安静卧床，避免劳累和精神刺激，应给予高热量、低脂肪、低渣和易消化的食物。补充铁剂、各种维生素和电解质(钠、钾、氯、钙、镁)，输血、血浆、人血白蛋白和多种氨基酸制剂。静脉给予高营养疗法有利于改善肠道功能与增强病人体质。使年轻人发育不受影响。因广泛回肠病变或切除后引起的腹泻，可用考来烯胺(胆酪胺)，脂肪吸收不良者可用中链三酰甘油，合并感染者可用抗生素，但应注意林可霉素和克林霉素(氯林可霉素)有引起溃疡性结肠炎样肠炎的可能。以上治疗对早期病人可收到明显效果。