南山区慢病院是南山区政府批准设立的属于公共卫生范畴的慢性病防治专业机构，主要任务是受各级政府委托承担完成全区各项慢性病控制项目、科研项目、预防保健工作和南油片区居民基本医疗服务要求。负责承担南山区慢性传染性疾病（结核病、性病、麻风病）和慢性非传染性疾病（高血压、糖尿病、恶性肿瘤、脑卒中、口腔疾病、意外伤害、口腔疾病和精神病）的预防与控制、突发疫情处理、健康教育促进、疾病监测、医学应用研究与指导、公共卫生信息处理、基层专业技术培训管理与服务、预防保健服务以及南油片区基础医疗服务。医院办院方向为：努力创建以政府赋予的慢性病防治各项工作任务，以开设具有专家级坐诊的有先进诊疗设备和专科特色服务的防治结合并重的慢性病专科门诊为主导，以提供南油片区居民低端的基本医疗服务为辅助的（即大专科小综合）集疾病预防与控制、医疗、科研、教学为一体的慢性病防治专业机构。力争用3-5年的时间我院逐步建成为全区慢性病预防与控制业务指导中心、肺结核和肺部疾病及皮肤性病诊疗中心。
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