安徽医科大学附属巢湖医院坐落在美丽的巢湖之滨，前身是中国人民解放军皖南军区陆军医院，安徽省第四康复医院，建于1951年9月。1954年3月迁到巢湖市现址。1960年7月，更名为安徽省立巢湖医院。1969年，医院下放巢湖地区，更名为巢湖地区人民医院。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为巢湖市第一人民医院。2005年成为安徽医科大学第六临床学院。2006年3月被评为三级甲等医院。2010年成为安徽医科大学非直属附属医院。2012年12月，经省人民政府批准，医院移交安徽医科大学管理，更名为安徽医科大学附属巢湖医院。2014年9月，安徽医科大学实行临床学院与附属医院“院院合一”，医院同时为“安徽医科大学巢湖临床医学院”。2015年4月，安徽医科大学附属巢湖医院成为17家省管医院之一。经过六十六年的建设和发展，已成为一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的三级甲等省管综合性医院。
医院占地面积16万平方米，医用建筑面积10万余平方米。现有编制床位880张，开放床位1294张，设置门诊部2个，临床科室35个，医技科室13个，教研室22个。年门诊量65万余人次，年收治住院病人4.6万余人次。全院职工总数1512人，卫生技术人员1309人，医药技人员577人，护理人员732人。
医院全面实施创新兴院、人才强院、质量立院三大战略，注重医疗、教学、科研建设。现拥有高级职称118人（其中主任医师35人）、中级职称408人、博士生导师3名、硕士生导师29名。享受国务院及省政府特殊津贴1人，安徽省江淮名医2人，省级以上学会主任委员3人，副主任委员7人。近年来，全院完成省级以上科研立项14项，其中国家自然科学基金项目2项。荣获国家级实用型发明专利4项、省级科技进步二等奖1项、市级科技进步奖1项。近三年已开展国家级继教项目6项、省级继教项目7项，并在各类医学期刊发表论文471余篇，其中SCI论文34篇，中文核心论文37篇。
医院设备齐全，装备精良，拥有64排和6排螺旋CT、1.5T超导型核磁共振、中能15兆伏直线加速器、数字血管减影系统（DSA）、DR、全自动生化分析仪、数字彩超、肺功能仪、人工心肺机、数字化胃肠机、钼靶乳腺机、电子胃肠镜、十二指肠镜、高清腹腔镜、手术显微镜、关节镜等大型医用设备，总价值近2亿元。
医院始终坚持“仁心仁术、求精求新”的办院宗旨，将医院的建设发展成果回馈社会。近年来，医院在抗震救灾，防治传染病，抢救车祸患者等突发公共卫生事件中，出色的完成了医疗救治的职能。医院还积极履行社会责任，大力推进民生工程，开展对口支援帮扶，坚持卫生下乡、下基层，积极为群众义诊、开展健康教育，组织对困难患者捐款捐物等，充分展示了医务人员奉献社会，服务人民的良好精神风貌。医院先后获得了“全国百姓放心示范医院”、“全国医药卫生系统先进集体”、“全国心电图比赛团体三等奖”、“安徽省劳动竞赛先进集体”、“安徽省 ‘致敬白衣天使•精彩故事——百优医生、百优护士’荣誉称号”、“安徽省新生儿窒息复苏知识与技能竞赛团体二等奖”、“安徽省高校附属医院首届青年医师临床技能竞赛团体三等奖”、 “安徽省第一届普外科腹腔镜技能大赛团体三等奖”、“安徽医科大学第三届大学生临床技能竞赛二等奖”、“巢湖市十大感动人物”、“巢湖市最美劳动者”等光荣称号。
