慢性萎缩性胃炎伴胃窦糜烂的治疗，一般可以遵从医生指导，通过服用抗生素、质子泵抑制剂、胃黏膜保护剂等药物进行治疗。
1、抗生素：慢性萎缩性胃炎伴胃窦糜烂可能是幽门螺旋杆菌所引起的，因此可以遵从医生指导，通过服用抗生素药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、克拉霉素缓释片等药物进行治疗。抗生素通常能够起到消炎杀菌的效果，并且还能够起到抑制细菌蛋白的合成，并且对于革兰氏阴性球菌也有很好的治疗效果。
2、质子泵抑制剂：质子泵抑制剂一般包括奥美拉唑肠溶片、艾司奥美拉唑肠溶片等，质子泵抑制剂通常能够起到抑制胃酸的分泌，并且还能够起到缓解胃酸分泌过多而引起的胃痛，也可以用来缓解幽门螺旋杆菌感染所引起的不适症状。
3、胃黏膜保护剂：胃黏膜保护剂有枸橼酸泌钾片、铝碳酸镁咀嚼片、硫糖铝咀嚼片等药物，通常能够起到保护胃黏膜的效果，并且还能够促进组织修复，一般用于治疗幽门螺旋杆菌、胃部疾病等。
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