百日咳杆菌（Bordetellapertussis）是百日咳的病原菌，为革兰氏阴性短小球杆菌，一般在培养基内需要大量（15％～25％）鲜血才能繁殖良好，血液-甘油-马铃薯（B-G培养基）对分离本菌最为适宜。新鲜分离的百日咳杆菌为Ⅰ相菌。Ⅰ相菌菌落光滑，有荚膜，毒力强，含内毒素和外毒素。连续转种菌落变粗糙后毒力逐渐减弱，抗原性强度也不相同，此种无致病力的百日咳杆菌称为第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ相。只有Ⅰ相百日咳菌致病产生症状，也必须用Ⅰ相菌制作疫苗才能产生免疫力。该菌在人体外生存能力很弱，室温下只能生存2小时，日光暴晒1小时或加热60℃15分钟即灭活，也能很快被一般常用化学消毒剂所消灭。鲍特氏菌属（Bordetellabacillus）中尚有副百日咳杆菌（B。parapertusis），支气管腐败杆菌（B。bronchiseptica）。此二者形态与百日咳杆菌相似，前者可引起类似百日咳的呼吸道症状，但与百日咳杆菌无交叉免疫。后者主要是动物致病菌。鲍特氏菌属中第四种是鸟鲍特氏菌（B。avium）是与支气管腐败菌相似的细菌，是鸟类的致病菌，还没有引起过人的感染。
1、呼吸系统并发症
支气管肺炎为婴幼儿常见的并发症，常在痉咳期发生。百日咳杆菌所致肺部病变以间质性肺炎为主，但常由继发细菌感染引起。也有痉咳时引起吸入性肺炎。此时体温可升高，痉咳变为不典型，但呼吸困难、发绀、肺部湿另外音比较突出。如支气管被粘液阻塞，可引起肺气肿；完全性阻塞可致肺不张；如肺泡破裂可引起气胸、纵膈气肿或皮下气肿；如支气管粘膜及肺间质破坏，日后可导致支气管扩张。
2、神经系统并发症
表现为百日咳脑病。系因脑组织缺氧、充血、颅内出血，损伤脑细胞和细菌毒素所致，幼儿多见。有意识障碍、惊厥等。脑脊液多无变化。
3、结核病恶化本病
可使原有肺结核恶化，甚至引起血行播散，发生粟粒性结核或结核性脑膜炎。
4、其他
舌系带与下切齿磨擦而致舌系带溃疡，由于剧咳时腹腔压力增高，可致脐疝、腹股沟疝、直肠脱垂等。
百日咳杆菌从易感者的呼吸道侵入，约经1～3周的潜伏期（一般7～10天）后出现症状，病程分3期，但无明显界限：
1、卡他期：一般为1～2周，开始有类似感冒的症状。3天左右后症状减轻，唯咳嗽加重，渐渐转变成阵发性痉挛性咳嗽。
2、痉咳期：阵发性痉挛性咳嗽是本期特点。痉咳发生时，先是频繁短促的咳嗽十多声以至数十声，患者处于呼气状态，随之是一次深长吸气，但此时喉部仍是痉挛状态，气流通过紧张狭窄的声门发出一种高调的吼声，如鸡鸣或犬吠样。如此反复上述咳嗽过程，直至把呼吸道积聚的粘痰咳出为止。由于剧咳，可致呕吐、大小便失禁、面红耳赤、口唇发绀、张口伸舌。剧咳可致上腔静脉回流受阻，出现颜面、眼睑浮肿，重者鼻粘膜、眼结膜出血，咯血，甚至颅内出血。痉咳发作无先兆，任何刺激都可诱发。若无继发感染，一般体温正常，肺部无阳性体征，或有患百日咳的儿童不固定的啰音。新生儿及6个月以内婴儿多无痉咳及特殊吼声，而是阵发屏气、紫绀，易惊厥、窒息而死亡。成人患者多数有典型症状，但也可能仅有几周干咳，大多仍坚持工作，并作为传染源，对此应予重视。痉咳期长短与治疗的迟早、病情轻重有关，短者数天，长者可达2月，一般为2～6周。
3、恢复期：痉咳减轻、停止，鸡鸣样吸气声消失，若无并发症，约经2～3周即愈。
一、隔离传染源
对本病患者严格执行呼吸道隔离，是重要的预防环节隔离期自起病开始，为期7周；或痉咳开始，为期4周密切接触的易感儿（特别在集体机构中）需检疫3周成人患者需注意避免接触小儿疫源地只需通风换气
二、保护易感者
1、主动免疫目前常用白百破（DPT，白喉类毒素、百日咳疫苗、破伤风类毒素）三联疫苗，对出生3～6个月的婴儿进行基础免疫，皮下注射三次在流行期，1个月的患儿即可接受疫苗接种强调全程免疫，以后再按规定加强百日咳疫苗偶可引起脑病等神经性反应，故原有脑部疾患或惊厥性疾病、或首剂百日咳疫苗注射后曾有惊厥者，一概不应再予注射乙型脑炎流行季节也不进行百日咳疫苗注射现用的全细胞百日咳疫苗虽发挥了一定的作用但效果尚不够理想，免疫后再患百日咳的儿童和成人发病者屡有报道
2、无细胞百日咳疫苗：即使用百日咳杆菌的某些组成部分，而不是用全个百日咳杆菌制成的百日咳疫苗，其保护效果较全细胞百日咳疫苗好，同时避免了全细胞疫苗的副反应1981年日本Sato开始用以百日咳毒素（PertussiuToxinPT）和丝状血凝素（FilamentoushemagglutminFHA）为主要组分的无细胞百日咳疫苗获得成功英、美、瑞典等国家随后研制各种无细胞百日咳组分的疫苗用于人群最得效果已证实无论何种无细胞百日咳组分疫苗，百日咳毒素（PT）抗原是必不可少的成分进一步研究揭示百日咳毒素单克隆抗体（PT-McAb）具有特异性中和体外和体内百日咳毒素的多种生物学活性的特征，同时也具有防御百日咳杆菌感染的保护作用
3、被动免疫对幼婴或体弱者，于接触病人后可给百日咳高效价免疫球蛋白，但预防和减轻症状的效果不显著，故应用者少
三、药物预防
婴儿接触病人后，即给红霉素每日50mg/kg，分4次口服，连用10～14天，效果较好
1、白细胞计数起病第1周末及痉咳早期，白细胞计数多增高，一般在2万～3万/mm3或更高，淋巴细胞占60％～80％。如有继发感染时，淋巴细胞即相对减少。
2、细胞培养起病初取鼻咽拭子、痉咳期用咳碟法收集标本，用B-G培养基作细菌培养，早期阳性率较高。卡他期初阳性率可达90％，痉咳期一般低于50％，痉咳2～3周后，培养几乎全部阴性。用直接荧光抗体染色法去检测培养基上的百日咳杆菌菌落是可靠的方法。
3、荧光抗体染色法检查用鼻咽拭子涂片，有快速诊断的优点，但本法特异性差，仅作辅助培养之用。
4、血清学检查作双份血清凝集试验及补结合试验，如抗体效价递升可予确诊。近有用酶联免疫吸附试验测IgM、IgG和IgA抗体，对早期诊断有所帮助。也有用单份恢复期血清凝集抗体1∶320效价作为阳性诊断值者。
多摄入一些高纤维素以及新鲜的蔬菜和水果，营养均衡，包括蛋白质、糖、脂肪、维生素、微量元素和膳食纤维等必需的营养素，荤素搭配，食物品种多元化，充分发挥食物间营养物质的互补作用。
一、一般疗法
按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。良好护理以预防并发症。注意营养。
二、抗生素治疗
应用于卡他期或痉咳期早期，可降低传染性，减轻症状并缩短病程。
1、红霉素每日40～50mg/kg，最大剂量2g/日，分3～4次口服，连服7～14天。也可加用TMP每日6mg/kg分二次口服，疗程为7天。
2、氨苄西林每日100～150mg/kg，肌注，疗程为7～10天。有谓需大剂量1～2g/次，每日肌注二次，连用7天，可能有效。
3、卡那霉素、复方SMZ及异烟肼亦可使用，疗程各7～10天。
三、对症治疗
祛痰止咳剂如氯化铵等。沙丁胺醇（舒喘灵，albuterol）0。5mg/kg能减轻咳嗽症状。氯丙嗪等可减少夜间咳嗽，有利睡眠。幼婴窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。可用普鲁卡因静脉滴注，每日1～2次，连用3～5天，以减少窒息或惊厥，需同时注意心率和血压。百日咳脑病时可用脱水剂。有低钙、低血糖等时，予以对症治疗。
四、并发症的治疗
按并发病种，给予相应治疗。
五、皮质激素
只短期应用于危重患者，如幼婴或有脑病者。强的松龙15～20mg/日，口服。或氢化可的松静脉给药。注意激素的副作用。