食物不耐受的原因很多，包括酶缺乏，食物中含有特殊的化学成分和胃肠道屏障作用破坏等，使得人体不能充分消化食物大分子，导致一系列症状。
1、过敏性休克：过敏性休克是人体对某些生物制品（如异体血清）或药品（如青霉素、含碘造影剂）过敏而产生的一种急性全身性反应。过敏性休克的表现与程度，依机体反应性，抗原进入量及途径等而有很大差别。通常都突然发生且很剧烈，若不及时处理，常可危及生命。
2、致命性哮喘：哮喘是由多种细胞特别是肥大细胞、嗜酸性粒细胞和T淋巴细胞参与的慢性气道炎症，在易感者中此种炎症可引起反复发作的喘息，气促、胸闷和（或）咳嗽等症状，多在夜间和（或）凌晨发生，气道对多种刺激因子反应性增高。
3、胃肠道水肿：过多的体液在组织间隙或体腔中积聚称为水肿（edema）。正常体腔中只有少量液体，若体腔中体液积聚则称为积水。
成年病人对严重的食物变应性通常是清楚的。若不清楚或在大多数儿童诊断可能是困难，需与胃肠道功能性障碍相鉴别。
对于进食后发生食物反应的可疑病人首先可用相应的皮肤试验来判断所发生的症状与食物的相互关系。阳性皮试并不能证实临床症状与变应性有关。但阴性试验可排除与变应性的关系。当皮试呈阳性，可用排除食物法来确定症状与食物过敏的关系。若症状好转，可再次给予该食物以确定其是否能诱发症状。所有的阳性激发试验应接着作双盲激发试验来确诊。排除食物法即在基本的食谱中排除了怀疑能引起症状的食物，或采用一种由相对无变应性食物所组成的食谱。
通常引起变应性的食物有牛奶，鸡蛋，贝壳，果仁，小麦，花生，大豆以及所有含一种或多种上述成分的食品。食谱从开始就应排除大多数普通变应原以及所有可疑的食物。在开始的食谱中除了那些特定的饮食外，不能进食其他食物或液体。不宜去餐馆吃饭，因为病人（和医生）需知道每道菜肴的确切组成。另外，需时常了解所用食物的纯度。如普通的黑麦面包包含着一些小麦粉。
若所给的食谱在一周后无改善，则应改换食谱，如症状缓解，可在食谱中添加一种新的食物以大于通常量进食24小时以上或直至症状再复发。另一种方法是医生在场时，进食少量试验食物，同时观察病人的反应。添加新食物后出现症状恶化或再发是对该食物有变应性的最好证明。此项证明需经核实，即从食谱中除去该食物数日重又加入，观察其效果。
一旦发现了需要忌食的食物，不但要将其排除在食谱以外，并且要形成买食物前先看原料成分列表的习惯，这样才能更好地保护自己另外，对某种食物不耐受，不等于再也不能吃了要想再吃某种食物，应间隔至少1周在“试吃”期间，应选择这种食物的一种简单制品，例如忌食奶制品，可以先吃活性酸奶，如果5天以上没有出现症状，再尝试牛奶，否则其他奶制品就不要进行尝试了
食物变应性和不耐受性的诊断出除了依靠爱上临床表现外，相关的辅助检查也是必不可少的。
1、抽血做食物耐受性检测。
2、过敏源检测。
通常引起变应性的食物有牛奶，鸡蛋，贝壳，果仁，小麦，花生，大豆以及所有含一种或多种上述成分的食品。食谱从开始就应排除大多数普通变应原以及所有可疑的食物。在开始的食谱中除了那些特定的饮食外，不能进食其他食物或液体。不宜去餐馆吃饭，因为病人（和医生）需知道每道菜肴的确切组成。另外，需时常了解所用食物的纯度。如普通的黑麦面包包含着一些小麦粉。若所给的食谱在一周后无改善，则应改换食谱，如症状缓解，可在食谱中添加一种新的食物以大于通常量进食24小时以上或直至症状再复发。
除了排除肇事食物之外，没有特殊的治疗。排除性食谱既可用于诊断，又可作为治疗。若只与个别食物有关，则宜禁食。对一种或多种食物的敏感性可自发消失。口服脱敏（先是排除肇事食物一段时间，然后从小量开始，逐日增量）和舌下滴入食物提取液脱敏均未能证明有效。除非有荨麻疹，血管性水肿等急性全身反应，抗组胺药很少有价值。口服色甘酸钠在其他国家有明显效果，然而在美国仅获准在肥大细胞增多症使用口服剂。除嗜酸粒细胞增多性肠病外，长时间使用糖皮质激素治疗并无指征。