一、与伤寒鉴别
1.细菌培养
发热期间血液和骨髓培养阳性率较高。胃肠炎型患者粪便培养易获阳性。有局部化脓病灶的患者，可从抽取的脓液中检出病原菌。
2.伤寒凝集试验
副伤寒甲、乙的凝集效价较高，但副伤寒丙的效价较低。少数患者在病程中伤寒凝集试验始终阴性。
伤寒的潜伏期长短因感染病菌的多少而不同，一般为1至3周。副伤寒潜伏期为3到10天。
二、应与下列疾病相鉴别
1.细菌培养鉴别
地方性斑疹伤寒(莫氏立克次体感染)、败血症(猪霍乱沙门氏菌为主)、病毒感染(伤寒杆菌为阴性)、钩端螺旋体病、布鲁菌病、粟粒型肺结核、急性病毒性肝炎(伤寒杆菌为阴性)、结核性脑膜炎(结核杆菌)、疟疾(疟原虫)
2.慢性肠炎
发烧、便溏，类似痢疾。多发于幼儿和老年人。
3.恶性组织细胞增生症
单核-巨噬细胞系统中组织细胞呈异常增生和浸润。临床表现主要表现为发热，肝、脾肿大、白细胞减少，贫血、出血。
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