能引起性生理功能障碍的因素很多，而且很多病人常是由多种因素作用引起的。出现性功能障碍后，病人常会拖一段时期（甚至几年）以待其自然好转，等到不能再拖时方来就诊，此时有些诱发因素可能已不能准确回忆。现将常见的有关因素列举如下：
一、社会文化背景因素
科学的性知识过去研究得很少，传布更不广，因此人们关于性的知识往往是道听途说而来，一般都认为谈论性问题是“下流”的，因此即使夫妻之间，也不一定有充分的交流，不知道什么样是适当的性行为，有了问题也不敢寻求帮助。
二、个人因素
最常见的是焦虑，例如怕自己的性能力不足以满足对方要求、怕怀孕、怕性行为被人发觉、怕被缺乏感情认为淫荡等。
三、双方关系
例如对对方过分尊重、恐惧、厌恶，双方缺乏感情或缺乏交流等。
四、不正确的知识
例如认为性行为应随停经而终止，到了一定年龄就不会有性能力，患某些疾病影响性行为等。过去认为手淫可引起性生理功能障碍，其实这是一种误解，手淫一般只引起睡眠不足，影响次日的精力，不引起特定的疾病。
五、其他疾病
某些疾病或某些药物确实可以影响性能力，特别是影响男性的勃起。一般言，急性病或短期用药虽常可影响性功能，但不引起注意；慢性病因为时间长，所以引起注意。其他疾病引起的性功能障碍只占少数，有一些还是因为焦虑引起的，例如怕进行性交加重疾病。
从未获得过性生活满足者称为原发的性功能障碍，以前有过正常的性生活经验者称为继发的性功能障碍。临床上后者较多见。
性功能障碍是影响男女双方的一种重要疾病，本病直接影响患者的自尊心和心理健康，损害夫妻感情及家庭稳定，成为很多成年男女的难言之隐。
性障碍包括性生理功能障碍及性心理障碍两大类，其各自的常见临床表现如下：
一、性生理功能障碍
这是指性器官没有解剖学的损害而出现的功能障碍，常见有以下几种形式：
(一)性欲缺乏
这可由于双方关系不良引起，如果过去有过良好关系，有时可通过心理咨询治疗得到恢复；如从未与对方有过好感，那就不是医疗问题，如果一方有兴趣而对方无兴趣，这可能是因为对方疲劳或其他原因引起，也可能是因对方的“挑逗活动(foreplay)”不足引起，女方对性交的恐惧也可以抑制性欲，治疗主要是向双方说明产生性欲缺乏的原因以寻求适当解决。
(二)性器官反应缺乏
这在男方主要是阴茎不能勃起或不能维持勃起时间到插入阴道(称为勃起障碍或阳萎)，在女方则表现为阴道滑润性液体分泌缺乏或不足，从未有过勃起者称为原发性阳萎，但绝大多数都是继发性，一过性的阳萎，如果只是与妻子性交未果出现阳萎，则主要是由于焦虑引起，治疗应寻找和消除引起焦虑的原因，如果阳萎不是“选择性”的，则应检查是否因其他疾病(包括精神疾病)或使用药物，酒精引起，女方缺乏阴道分泌主要由于性欲缺乏或挑逗不足引起。
(三)快感缺乏
这较多见于女性，因为男方在射精后阴茎很快失去勃起状态，不复能在阴道内动作，而妇方此时尚未达到快感，如果能适当延长性交动作或延迟射精就可使男女双方都同时获得快感，治疗主要是让男女双方了解对方的感觉，在女方产生充分的性器官反应后再将阴茎插入阴道，或在出现将要射精的感觉时暂停动作，使射精时间推迟，男方在阴茎插入阴道前即已射精，称为早泄，这也影响快感，这种情况可在头几次性交或经长期间断后恢复性交出现，不需处理，阴茎插入阴道后需维持多长的时间射精才不算早泄，这并没有一定的标准，时间即使很短，如果已能使女方产生快感，就可以不算早泄，西方一度提倡用“挤压法”来治疗早泄，目前认为用在将要射精时暂停动作或拔出阴茎，稍停之后重新开始(称为“开始—停止法”)的方法更好，当然，在进行这种治疗时男女双方的相互了解，相互配合是非常重要的，而且是获得成功的前提。
(四)性交疼痛
主要见于女方，可以由于性交时阴道分泌不足或局部炎症或男方动作粗暴等原因引起，一次这种疼痛的经验可以使以后的性交时因为害怕而产生阴道痉挛，从而出现疼痛，加强相互关心，改进性技巧，治疗局部疾病常可使疼痛减轻或好转。
以上所述是常见的性生理功能障碍，主要是正常的性生活的四个阶段中第二及第三阶段的障碍，夫妻关系良好是治疗成功的必要条件，当然，如果关系不好是由于这些障碍引起的，那么首先要树立能治好的信心，治愈后就能使关系恢复正常，对男女双方灌输正确的性知识，是树立治疗信心的必要步骤。
二、性心理障碍
人的性活动，人生物学的角度来说，是以指向异性，发生性器官接触，达到产生下一代为目的的，这是与其他动物共同之点，但是，作为高等动物的人，不知从什么时候起，生育已不是每次性生活的目的了，而指向异性，进行性交仍是绝大多数人的性活动过程，凡是不符合这一过程而又没有性器官解剖生理缺陷的就被称为性心理障碍(或称性变态，性欲倒错等)，性心理障碍大多病因未明，有一部份可能与少年儿童期的生活历有关，治疗大多困难，近年来使用行为疗法，有时可以好转，较常见或较常提到的性心理障碍表现有以下几种：
(一)同性恋
前已提及，绝大多数人的性爱都是指向异性，排斥同性的(可以称为异性恋)，如果相反，则称为同性恋，同性恋者并不都完全排斥异性，一对同性恋者常有一人较主动，一人较被动，被动者的排斥异性的倾向较小，因此有些最后可以脱离同性恋而与异性结婚，造成主动者的“失恋”，完全的，终身的同性恋者较少；爱好同性但因受社会传统的约束而与异性结婚者，或以异性恋为主，对某些同性也有性爱的爱好者较多，同性恋者男女均有，在西方报道较多，在我国也有，但报道不多，同性恋者可以采取与异性夫妇一样的生活方式，有性挑逗及模拟的性交行为；但也有一部分是“精神恋爱”，在我国，男性同性恋者如被发现有性行为常被作为流氓行为处理，同性恋一般被认为是违反生物学规律的不正常现象，而且被作为精神医学的一个课题，但目前在有些地方(例如美国)，由于同性恋者众多，他们认为把同性恋作为不正常是侵犯他们的人权，造成一定声势，因此美国精神医学会不得不在精神疾病分类中取消同性恋这个项目，近年来，因为发现艾滋病与同性恋关系密切，因此同性恋有所减少。
同性恋因为原因不明，所以目前无特效的处理方法。
(二)异装癖
是指具有异性恋的成年男性反复穿着女性服装以获得性兴奋者，不包括不引起兴奋的，因为特殊需要或是社会流行的穿着方式，异装癖实际上应称为异性服装癖，但一般不包括女性穿男性服装者。
(三)露阴癖
一般都是男性，突然在陌生女性面前露出自己的生殖器，引起对方的注意后立即逃逸，此时即可获得性兴奋，并不要求有进一步的性行为。
(四)恋物癖
一般是男性，所恋之物主要是与女性身体密切接触的东西(如内衣内裤)或女性头发等，获得这些东西时即可产生性兴奋，因此千方百计去收集，甚至偷抢这些东西。
(五)施虐癖和受虐癖
即反复的以虐待异性或受到异性虐待作为获得性满足的行为，这种虐待是指可以致伤的或精神上受到严重侮辱的虐待，而所产生的性满足常常超过性交所获得者，作为性交前奏的“打”情“骂”俏，因为不引起精神和肉体伤害，所以不属于施虐或受虐。
(六)易性癖
这种人有强烈的成为异性的要求，男女都有，通过外科手术及性激素使自己变成异性，西方进行这类手术已有数十年历史，我国近十多年来也有开展，变性手术是目前对易性癖唯一有效的治疗，外科医生在术前必须仔细排除这种易性的想法是否与某些精神疾病有关，并要仔细说明术后可能受到的环境压力。
导致性障碍的原因较多，有生理性的，也有心理性的，为了预防本病的发生，广大朋友应该注意下面几点：
1、树立性的正确认识由于我国受到几千年封建思想的影响，把性知识神秘化，或视为下流淫秽，从不公开讨论，只是私下流传，更少有人研究，其实，性与饮食，大小便一样，都是生活行为，都是正常的生理现象，认为性行为不光彩，下流，性交无非是生儿育女，传种接代，性交有损健康等错误观念，需在思想上加以摒除，否则会对正常的性生活产生不利的影响
2、去除精神压力除上述的许多错误观念外，还有各种各样的恐惧感，会产生强大的精神压力，抑制性兴奋反应，如在性交前性反应正常，阴茎勃起良好，而一旦行事，阴茎立即萎软，害怕性伴不满，害怕性伴不适等
3、创造安定的性交环境性交的环境对性反应的发展具有十分重要的影响，应避免性交外的任何干忧
4、创造一个十分轻松愉快的气氛性交前和性交时，必须保持亲热和睦的气氛和情绪
5、相互照顾各自的爱好性交常是男女爱情的最高表现，在做爱和性交的过程中，如能相互照顾，各自主动地投其所好，可增进爱情，增长快感
6、注意表示性要求的艺术性当要向性伴提出性要求时，最好不要直言，注意表达的艺术
7、熟知性器官的生理功能性交前做爱和性交时，应充分注意到最易诱发性兴奋的部位
针对性功能障碍复杂的病因，运用多普勒阴茎动脉血流分析仪，男性性功能动态诊断系统，性激素检测系统，尿动力学分析仪等尖端仪器进行专项检测，包括性激素水平，前列腺，勃起测定，阴茎血流量，血糖，血压等，能准确查明导致性障碍的病因，采取针对性的治疗措施。
对于性障碍患者来说，本病给自身带来了巨大的身体和生理上的伤害，建议本病患者应该注意下面的饮食建议：
1、多食优质蛋白质
优质蛋白质主要是指各种动物性食物，如鸡、鸭、鱼、瘦肉、蛋类，可提出供人产生精子所需用要的各种氨基酸。一些动物性食品本身就含有一些性激素，有利于提高性欲及精液、精子生成，促进性障碍的恢复。
2、适当摄入脂肪
调查表明，长期素食的女性，月经初潮年龄推迟，雌激素分泌减少，性欲降低并影响生殖能力。男性由于必需脂肪酸摄入减少，精子生成受到限制，性欲下降，甚至不育。
3、补充维生素和微量元素
研究证明，维生素a和e是与维持性功能并延缓衰老有关的维生素。它们在促进睾丸发育、增加精子的生成并提高其活力等方面具有决定性作用。维生素c对性功能的恢复也有积极作用，其富含于鲜枣、山楂、青椒、西红柿等果蔬中。
治疗性功能障碍患者需要采取综合方法。对患有器质性疾病的患者要积极治疗原发病，药物引起者停用药物。
1、性教育及心理治疗
加强性知识的指导，消除对性问题的顾虑和恐惧，纠正错误的性观念及性交方法，使夫妻性生活更加协调。心理治疗强调个体化治疗方案，常用的有精神分析法、厌恶疗法、系统脱敏疗法、家庭疗法等。
2、性行为治疗
主要是通过性感集中训练，使患者逐渐适应、熟悉性交过程，提高患者对性反应的自身感觉，充分享受性交的快感，减轻对性交的焦虑和恐惧。治疗过程中对方应避免对患者性体验、性自尊心和性幻想的不良刺激，避免有害的性引诱活动。耻骨尾骨肌训练对于在分娩后有盆底肌肉松弛现象或耻骨尾骨肌不发达的女性特别有效。
3、药物治疗
治疗勃起功能障碍，首选PDE5抑制剂，如西地那非、伐地那非、他达拉非等。早泄可选用选择性5—羟色胺再摄取抑制剂。口服左旋多巴、麻黄素等有促进射精作用。三环类抗抑郁药是治疗性恐怖症和抑郁的首选药物。雌激素替代治疗可增加阴蒂的敏感性和性欲，减轻性交疼痛。对于有焦虑情绪或抑郁症等心理疾病时进行相应的药物治疗。
4、物理治疗
电动按摩器可以促进男性射精。使用振荡器、阴茎模型可增加女性的刺激。
5、手术治疗
主要是针对阴茎本身疾病，如伴有包皮口狭窄的包皮过长和包茎患者，可采用手术治疗，一方面有利于阴茎的充分勃起，同时切除包皮显露龟头可增加其对刺激的敏感性，有利于射精。