定远县总医院位于定远县城东新区。2008年6月，为了有效整合县级医疗机构资源，避免重复投资建设，打造区域医疗中心，在原县人民医院和县中医院两所二级甲等医院的基础上组建县总医院，对县人民医院和县中医院实行统一行政管理、统一资源使用和统一人员调配。定远县总医院为非营利性二级甲等综合性医院，为社会公益类事业法人单位，承担全县的医疗、教学、科研、预防、保健、康复等工作。总院设立管理机关，根据职责和工作任务，管理机关内设7个职能机构，分别为办公室、人力资源股、质量与科技管理股、财务股、后勤股、市场发展规划发展股、审计股。并按规定设立了工会、团委。
总院下设定远县人民医院、定远县中医院、药品器材采购管理中心、急救中心、滁州血站定远采血点、永康分院等医疗分支机构。组成机构分布包括总医院新区、南门门诊部、曲阳路门诊部、花园湖门诊部、永康分院。
县总医院新区占地168亩，总投资3.12亿元，2009年4月份开工建设，2012年5月投入使用。县总医院现有在职职工1156人，其中，高级职称31人、中级职称260人。医院拥有临床病区21个，开设一级临床科室15个，临床二级专业组25个，医技科室13个，门诊部4个，医疗辅助科室3个，建筑面积7.5万平方米；开放床位845张，拥有拥有直线加速器、DSA数字减影血管造影仪、核磁共振、螺旋CT、大型X光机等先进的诊疗设备；2014年度，医院年门急诊就诊人数48.05万人次，出院人数4.7万人次；实现年业务收入3.47亿元。
近年来，县总医院充分发挥农村三级卫生服务网络的龙头作用，培训基层医务人员，试点医师多点执业，推动双向转诊工作、承担并指导全县院前急救和卫生应急医疗救治工作。作为全国和安徽省县级公立医院改革试点单位，2012年10月15日,医院实行了药品零差率销售，降低核磁共振、CT等大型医疗设备收费，提高护理费、手术费等服务收费；建立以医管会为核心的法人治理结构，形成了政府有效监管、医院自主发展的管理运行模式；在药品集成配送、医保支付改革、专家会诊补偿、分工协作机制、收入分配制度、服务能力提升等六个方面进行积极探索。建立了“重点学科发展基金”，大力发展优势学科，现有省级重点中医专科2个。同时，医院利用信息技术，优化医疗服务流程、强化内部科学管理、加强城乡分工协作，实现了上联省级三甲医院、下接乡村医疗机构的远程会诊教学活动。
长期以来，县总医院积极落实各项惠民、便民政策措施，广泛开展“创先争优”、“三好一满意”和“优质护理示范工程”等优质服务活动，把群众满意度作为考核重要指标，发挥绩效考核的导向作用，调动医务人员工作积极性，竭诚为广大人民群众提供优质、价廉、安全、高效的医疗卫生服务。
总院的成立标志着该县按照十七大报告提出的“深化公立医院改革”和“管办分开”的要求，充分整合了现有的县级公立医疗卫生资源，正式迈上规模化、科学化发展的道路。总院将通过进一步深化干部人事制度和分配制度改革，建立权责明晰、富有生机、运转高效的管理体制和有责任、有约束、有激励、有竞争、有活力的运行机制，逐步探索和建立公立医院法人治理结构，进一步完善现代化医院管理制度；以总院为平台，积极吸纳社会资金，开展多种形式合作，做好城东新区医院和县中医院建设，共同发展该县医疗卫生事业,为全县广大人民群众提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务。
