咽肌麻痹的发生原因可分为中枢性和周围性瘫痪二类。中枢性见于各种原因引起的延髓病变，如延髓瘫痪、假性延髓瘫痪、小脑后下动脉血栓形成、脑炎、听神经瘤侵及延髓、延髓空洞症等。周围性麻痹则以多发性神经炎多见，其他如感染、颈静脉孔综合征、肉毒杆菌中毒、重症肌无力、皮肌炎及颅底病变(外伤、肿瘤)压迫第Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ脑神经而引起。
咽缩肌麻痹时，吞咽机能受到影响，早期进流质有困难，而进食固体食物无阻挡，逐渐发展可有误吸入喉内的危险。吞咽困难(dysphagia)是指食物从口腔至胃、贲门运送过程中受阻而产生咽部、胸骨后或食管部位的梗阻停滞感觉。进食流质或固体食物均无困难，这类患者常伴有神经官能症的其他症状。
根据病变范围不同，咽肌麻痹可分为完全性或不完全性，单侧或双侧性。单侧麻痹常无症状，双侧则较重，由于软腭麻痹，鼻咽不能闭合，患者说话时有开放性鼻音，进流质饮食时易返流于鼻腔，进食固体食物则影响不大。
查体，张口发“啊”音时，可见健侧移动而患侧不能上举;若两侧麻痹，则软腭松弛，不能上抬。咽缩肌麻痹，则在梨状窝中可见唾液或食物潴留。
咽肌麻痹主要是病因的预防，原因可分为中枢性和周围性瘫痪二类中枢性见于各种原因引起的延髓病变，如延髓瘫痪、假性延髓瘫痪、小脑后下动脉血栓形成、脑炎、听神经瘤侵及延髓、延髓空洞症等周围性麻痹则以多发性神经炎多见，其他如感染、颈静脉孔综合征、肉毒杆菌中毒、重症肌无力、皮肌炎及颅底病变(外伤、肿瘤)压迫第Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ脑神经而引起一般是针对以上病因进行预防
咽肌麻痹的影像学检查可以明确病因，指导治疗。X线胸部平片可了解纵隔有无占位性病变、压迫食管及食管有无异物等；食管X线钡餐检查可观察钡剂有无滞留，以判断病变为梗阻性或肌蠕动失常性。必要时采用气钡双重吞咽了解食管黏膜皱襞改变，内镜及活组织检查可直接观察到食管病变。
咽肌麻痹患者宜吃蛋白质含量高、质地柔软、流质性的饮食，忌吃辛辣、刺激性和生硬的食物。根据不同的症状，也有有不同情况的饮食要求，具体询问医生，针对具体的病症制定不同的饮食标准。
咽肌麻痹的西医治疗方法是针对病因治疗。中枢性者请内科、神经科协同诊治；对周围性麻痹患者可用抗胆碱脂酶药或神经兴奋剂、维生素类药物治疗，并可进行针灸治疗；咽缩肌瘫痪不能进食或有误吸者应插鼻胃管或针刺疗法，常用的穴位有风池、大椎、少商、廉泉、天枢、曲池等。